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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Émeline Charbonnel

Emeline Charbonnel

Émeline CHARBONNEL
Courriel : emeline.charbonnel(at)cirad.fr
Sujet : Informer les flux d'organismes invasifs liés aux transports commerciaux : validation d'outils moléculaires haut-débit pour le suivi de la mouche orientale des fruits Bactrocera dorsalis
Dates : 1er octobre 2020 – 30 septembre 2023
Encadrement CBGP : M.P. Chapuis
Université : Université de Montpellier, ED Gaïa

La mouche orientale des arbres fruitiers, Bactrocera dorsalis, native de l’Inde, de l'Asie du Sud-Est et de la Chine subtropicale, s’est récemment imposée comme un ravageur majeur en arboriculture et maraîchage en Afrique sub-saharienne et dans l’océan Indien. L’espèce est un organisme réglementé dans de nombreux pays et dans l’UE, où elle est fréquemment interceptée aux points d’entrée. Depuis peu, elle est également capturée hors des zones des points d’entrée, dans le cadre du plan de surveillance européen (e.g. Autriche, France, Italie).

Nous sommes actuellement démunis pour retracer l’origine géographique de ces interceptions et par conséquent pour informer et orienter les stratégies de contrôle. Par ailleurs, les processus de recolonisation saisonnière des vergers dans les zones déjà envahies, en particulier le rôle de la dispersion passive, restent à ce jour fortement méconnus. Les marqueurs SNP (Single Nucleotide Polymorphism) générés massivement par séquençage haut-débit couplés à des méthodes innovantes d'inférence statistique offrent un espoir nouveau pour combler ces manques.

Cette thèse a pour ambition d’identifier (1) l’origine géographique des mouches de quarantaine capturées par les services chargés de l'inspection phytosanitaire européenne et (2) les routes de commerce de la mangue pouvant jouer un rôle dans les recolonisations saisonnières des vergers sénégalais en début de saison de production. Les résultats permettront de mieux orienter l’effort de contrôle sur les filières et frontières à risque mais également de formuler des recommandations méthodologiques pour d’autres espèces d’insectes invasives.