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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

Galan Maxime

IR2, INRAE ECODIV

Analyse du polymorphisme génétique chez les espèces non-modèles

Mon activité principale consiste à développer et mettre en place des stratégies moléculaires d’étude de la variabilité génétique des populations naturelles (vertébrés et pathogènes ou proies associés). Ces méthodes concernent la caractérisation de séquences nucléiques, de génotypes ou de niveaux d’expression géniques de marqueurs moléculaires, à l’échelle de quelques gènes jusqu’au génome/transcriptome. Elles font notamment appel aux technologies de séquençage de nouvelle génération et à leurs applications (metabarcoding, 16S rRNA amplicon sequencing, RADseq, Genotyping By Sequencing, RNAseq).

Groupe thématique de rattachement: Approches moléculaires et bioinformatiques haut débit

Voir aussi

Publications récentes les plus significatives:

Chapuis M.P, Benoit L, Galan M. 2023. Evaluation of 96-well high-throughput DNA extraction methods for 16S rRNA gene metabarcoding. Molecular Ecology Resources doi.org/10.1111/1755-0998.13812
Galan M, Bordes A, Gauthier P, Kane M, Niang Y, Pierre E, Granjon L. 2023. The diet of the African Giant White-toothed Shrew Crocidura olivieri (Soricomorpha: Soricidae) in commensal context: predation on co-existing invasive House Mouse suggested by DNA metabarcoding data. Mammalia doi.org/10.1515/mammalia-2023-0021
Quéméré E, Aucourd M, Troispoux V, Brosse S, Murienne J, Covain R, Le Bail PY, Olivier J, Tysklind N, Galan M. 2021. Unravelling the dietary diversity of neotropical top predators using scat DNA metabarcoding: a case study on the elusive Giant Otter. Environmental DNA doi.org/10.1002/edn3.195
Tournayre O, Leuchtmann M, Filippi-Codaccioni O, Trillat M, Piry S, Pontier D, Charbonnel N, Galan M. 2020. In silico and empirical evaluation of twelve metabarcoding primer sets for insectivorous diet analyses. Ecology & Evolution doi.org/10.1002/ece3.6362
Forin-Wiart MA, Poulle ML, Piry S, Cosson JF, Larose C, Galan M. 2018. Evaluating metabarcoding to analyse diet composition of species foraging in anthropogenic landscapes using Ion Torrent and Illumina sequencing. Scientific Reports 8: 17091 doi:10.1038/s41598-018-34430-7
Galan M, Pons JB, Tournayre O, Pierre E, Leuchtmann M, Pontier D, Charbonnel N. 2018. Metabarcoding for the parallel identification of several hundred predators and their prey: application to bat species diet analysis. Molecular Ecology Resources 18(3): 474-489 doi:10.1111/1755-0998.12749
Rohfritsch A*, Galan M*, Gautier M, Gharbi K, Olsson G, Gschloessl B, Zeimes C, Van Wanbeke S, Vitalis R, Charbonnel N. 2018. Preliminary insights into the genetics of bank vole tolerance to Puumala hantavirus in Sweden. Ecology & Evolution 8(22):11273-11292 doi:10.1002/ece3.4603 *co-first authors
Galan M, Razzauti M, Bard E, Bernard M, Brouat C, Charbonnel N, Dehne-Garcia A, Loiseau A, Tatard C, Tamisier L, Vayssier-Taussat M, Vignes H, Cosson JF. 2016. 16S rRNA amplicon sequencing for epidemiological surveys of bacteria in wildlife. mSystems 1(4): e00032-16 doi:10.1128/mSystems.00032-16

Liste complète des publications