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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Centre de Biologie pour la Gestion des Populations - UMR Inra, IRD, Cirad, Montpellier SupAgro

Charles Perrier

Perrier
J’utilise des approches de génétique et génomique des populations avec pour objectifs d'une part de contribuer à mieux comprendre l’écologie et l’évolution des populations, notamment dans le contexte du changement climatique, des invasions biologiques, et de cocktails de polluants, et d'autre part à conseiller le développement de politiques publiques pour adapter la gestion de ces populations.

J'étudie notamment l'évolution d'insectes tels que la chenille processionnaire du pin et le papillon de cendre, et de poissons tels que la gambusie et le saumon atlantique. J'analyse les mécanismes génomiques impliqués dans l'adaptation de ces espèces dans des milieux hétérogènes, notamment le climat et/ou les polluants. J'étudie également la dynamique de l'adaptation et du fardeau génétique dans le cadre de l'expansion spatiale des populations, par exemple dans le contexte de la progression de la chenille processionnaire du pin vers le Nord de la France. Du point de vue appliqué, ces études visent à mieux prédire les capacités d'adaptation des populations et espèces dans le contexte du changement climatique et des invasions biologiques afin d'en adapter la gestion.

Avant de m'intéresser également aux insectes à l'INRAe depuis 2019, j'ai travaillé sur la génomique de populations d'oiseaux de 2015 à 2019 au CNRS à Montpellier, et sur la génomique de populations de poissons de 2011 à 2015 à l'Université Laval au Québec et de 2007 à 2010 pendant ma thèse à l'INRA à Rennes. 

Quelques articles publiés :

Caizergues AE, Le Luyer J, Gregoire A, Szulkin M, Senar JC, Charmantier A, Perrier C. 2022. Epigenetics and the city: non-parallel DNA methylation modifications across pairs of urban-rural Great tit populations. Evolutionary Applications.

Perrier C, Rougemont Q, Charmantier A. 2020. Demographic history and genomics of local adaptation in blue tit populations. Evolutionary Applications. 

Perrier C, Lozano del Campo A, Szulkin M, Demeyrier V, Gregoire A, Charmantier A. 2018. Great tits and the city: Distribution of genomic diversity and gene-environment associations along an urbanization gradient. Evolutionary Applications. 

Perrier C, Ferchaud AL, Sirois P, Thibault I, Bernatchez L. 2017. Do genetic drift and accumulation of deleterious mutations preclude adaptation? Empirical investigation using RADseq in a northern lacustrine fish. Molecular Ecology.

Perrier C, Bourret V, Kent MP, Bernatchez L. 2013. Parallel and non-parallel genome-wide divergence among replicate population pairs of freshwater and anadromous Atlantic salmon. Molecular Ecology.

Perrier C, Guyomard R, Bagliniere JL, Evanno G. 2011. Determinants of hierarchical genetic structure in Atlantic salmon populations: environmental factors vs. anthropogenic influences. Molecular Ecology.

Quelques projets financés :

Projet ANR PRC 2023-2026 LOADEXP Coordination principale C. Perrier

Projet Biodivoc consortium 2022-2025 GambOc Coordination principale E. Farcy, Coordination CBGP C. Perrier https://biodivoc.edu.umontpellier.fr/recherche/projets-consortium/projet-de-consortium-gamboc/

Projet annuel labex CEBA 2019 DARTFROG Coordination M. Chouteau & C. Perrier 

Voir aussi

Page perso : https://sites.google.com/site/charles55perrier/publications-preprints