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INRAE
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

Tavoillot

Assistante ingénieur en techniques biologiques - spécialisée en Nématologie (IRD) Institut de Recherche pour le Développement- Département ECOBIO (Ecologie, Biodiversité et Fonctionnement des Ecosystèmes Continentaux)

J’interviens en appui à des programmes de recherche portant sur l’écologie de communautés phytoparasites, et plus particulièrement sur la caractérisation des composantes des communautés dans les écosystèmes (systématique intégrative des espèces et variabilité infraspécifique, métagénomique, barcoding) pour comprendre l’évolution des interactions qui les régissent (mécanismes de coexistence des espèces ; réponses aux filtres évolutifs, climatiques, environnementaux et anthropiques).

Groupe de réflexion	Champ d'application
Origine et caractérisation de la biodiversité	Ecologie des communautés phytoparasites

Missions

• Caractérisation de la diversité : composition spécifique et infra spécifique, diversité, richesse, dominance et structuration spatiale

• Valorisation scientifique

• Gestion technique de la quarantaine végétale de nématologie norme NS2 (agrément préfectoral n°2014023-0001)

Activités

Acquisition de données

Echantillonnage et isolement

-Organisation, mise en œuvre et acquisition des données de prospection

Caractérisation taxonomique

=> approches morphobiométriques

- Identification morphologique (famille/genre) assistée par imagerie

=> approches biochimiques et moléculaires

- Diagnostic biochimique (isoenzymes)

- Diagnostic moléculaire (PCR/ qPCR/ SCAR)

=> approches métagénomique

- Caractérisation des communautés (NGS)

Analyses de données

Analyse et interprétation des données biologiques et écologiques

- Analyse des données moléculaires (Bioedit, Geneious, SESAME Barcode)

- Analyses statistiques (critères de diversité, corrélations multiples, co-inertie) ADE4 et ADE «R»

Gestion des données biologiques et écologiques

- Traçabilité informatique (EXCEL, base de données PINS)

Valorisation

Production scientifique (cf. publications)

Formations dispensées et encadrements (personnel technique et scientifique, étudiants)

AQ/ HS

Gestion système qualité interne (quarantaine de Nématologie NS2)

Commun

Plateforme BM : Gestion des équipements et salle électrophorèse

Plateforme Collection : Référent collection nématodes phytoparasites

Plateforme SEPA : Responsable technique Quarantaine de nématologie NS2

Projets

Porteur de projet T. Mateille

Porteur de projet JF. Martin

-PESTOLIVE (ARIMNet 2012-2016): Contribution of olive history for the management of soil-borne parasites in the Mediterranean basin

-GEDUNEM (SMATCH INRA 2014-2016): Varietal and technical innovations for the sustainable and integrated management of root-knot nematodes in protected vegetable cropping systems

-STRADIV (Agropolis Fondation2015-2018) System approach for the TRAnsition to bio-DIVersified agroecosystems, from process analysis to multi-scale co-conception with actors

-MITE DIET (Montpellier SupAgro / EMBRAPA) Understanding trophic interactions among mites in agrosystems

-METARIVE (IMBE / Montpellier SupAgro) Caratérisation des interactions entre communautés bactériennes / réseaux trophiques et architecture génomique des Poissons Cyprinidae.

Voir aussi

Curriculum vitae

Formation

-Depuis 2005 : Assistante-Ingénieur IRD, UMR CBGP, Montpellier

-2000-2005 : Technicienne Supérieure en immuno-diagnostic, Cézanne-Thermofisher, Nîmes

-2000 : Technicienne Supérieure en microbiologie, Service Vétérinaire, Nîmes

-1998-2000: Assistante ingénieur CIRAD-IRD, Montpellier

-2015-2016 M2 BIOTIN Management de projets et innovation en Biotechnologie- Univ. Nîmes

-2014 M1 BIOTIN (VAP) Management de projets et innovation en Biotechnologie- Univ. Nîmes

-2012 Licence professionnelle (VAE) Métiers de la Biotechnologie- Univ. Nîmes

-1997 BTS Biotechnologie- Univ. Marseille

Publications récentes

-Ali N, Tavoillot J, Chapuis E, Mateille T. 2016. Trend to explain the distribution of root-knot nematodes Meloidogyne spp. associated with olive trees in Morocco. Agriculture, Ecosystems and Environment, 225 : 22-32. doi:10.016/j.agee.2016.03.042.

-Mateille T, Tavoillot J, Martiny B, Dmowska E, Winiszewska G, Ferji Z, Msanda F, El Mousadik A. 2016. Aridity or low temperatures: what affects the diversity of plant-parasitic nematode communities in the Moroccan argan relic forest? Applied Soil Ecology, 101 : 64-71. doi:10.1016/j.apsoil.2015.11.026.

-Aït Hamza M, Ferji Z, Ali N, Tavoillot J, Chapuis E, El Oualkadi A, Moukhli A, Khadari B, Boubaker H, Lakhtar H, Roussos S, Mateille T, El Mousadik A. 2015. Plant-parasitic nematodes associated with olive in southern Morocco. International Journal of Agriculture & Biology, 17 : 719-726. doi:10.17957/ijab/14.0004.

-Ali N, Tavoillot J, Mateille T, Chapuis E, Besnard G, El Bakali A, Cantalapiedra-Navarette C, Liebanas G, Castillo P, Palomares-Rius JE. 2015. A new root-knot nematode Meloidogyne spartelensis n. sp. (Nematoda : Meloidogynidae) in Northern Morocco. European Journal of Plant Pathology doi:10.1007/s10658-015-0662-3.

-Caporalino C, Fazari A, Marteu N, Navarrete M, Dufils A, Tchamitchian M, Furnion C, Lefèvre A, Pares L, Mateille T, Tavoillot J, Palloix A, Sage-Palloix AM, Védie H, Goillon C, Forest I, Castagnone-Sereno P. 2015. Le projet GEDUNEM : innovations techniques et variétales pour une gestion durable et intégrée des nématodes à galles dans les systèmes maraîchers sous abris. CR AFPP, 5ème Conférence Internationale sur les Méthodes Alternaties de Protection des Plantes, Lille, mars 2015.

-Ali N, Chapuis E, Tavoillot J, Mateille T. 2014. Plant-parasitic nematodes associated with olive tree (Olea europaea L.) with a focus on the Mediterranean Basin: a review. C.R. Biologies, 337: 423-442.doi:10.1016/j.crvi.2014.05.006.

-Collange B, Navarette M, Montfort F, Mateille T, Tavoillot J, Martiny B, Tchamitchian M. 2014. Alternative cropping systems can have contrasting effects on various soil-borne diseases: relevance of a systemic analysis in vegetable cropping systems. Crop Protection, 55: 7-15. doi:10.1016/j.cropro.2013.10.002.

-Mateille T, Tavoillot J, Martiny B, Fargette M. 2014. Importance of soil characteristics for plant-parasitic nematode communities in European coastal foredunes. European Journal of Soil Biology, 64 : 53-60.doi:10.1016/j.ejsobi.2014.08.002.

-Védie H, Mateille T, Tavoillot J. 2014. Soil solarization and crop rotation to manage root-knot nematodes in organic greenhouses. Acta Hort., 1041: 87-94. doi:10.17660/ActaHortic.2014.1041.8.