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Dernière mise à jour : Mai 2021

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CDD Ingénieur en modélisation

CDD ingénieur en modélisation
Contrat de 16 mois
Poste à pourvoir le 1er décembre 2021

Chef de projet pour le projet GrapeInSilico :  Une plateforme de modélisation structure-fonction pour l’adaptation de la Vigne aux nouvelles contraintes.

 

INRAE, Institut National de Recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement.

UMR LEPSE – Montpellier, UMR EGFV & SAVE – Bordeaux.

Présentation

Le projet GrapeInSilico a pour objectif de créer un environnement de haute qualité logicielle permettant de rassembler et de mobiliser les modèles développés au sein de l’institut Carnot Plant2Pro dans le domaine de l’écophysiologie de la vigne. Il propose ainsi d’intégrer, sur une même plateforme informatique, différents modèles structure-fonction développés et publiés au sein de trois entités Plant2Pro (LEPSE, EFGV et SAVE), de les enrichir de tutoriaux et de participer à leur diffusion auprès des acteurs de la recherche et de nos partenaires privés. GrapeInSilico sera développé au sein la plateforme OpenAlea, reconnue internationalement et adoptée par une communauté large dans le domaine de la modélisation des plantes. Les applications visées au terme du projet concernent principalement l’assistance au phénotypage et l’optimisation des capteurs pour le suivi des plantes. D’un point de vue socio-économique, les enjeux de ce projet sont de guider et d’accélérer l’amélioration variétale ainsi que la conception de modes de conduite innovants pour s’adapter aux nouvelles contraintes de la filière

Missions

Vous aurez dans un premier temps à créer un portail web permettent de communiquer sur le projet et de rediriger vers l’ensemble des documentations, tutoriaux et codes du projet. Dans une seconde phase, en étroite collaboration avec les chercheurs modélisateurs impliqués dans le projet,  vous réaliserez l’intégration des modèles constitutifs de GrapeInSilico dans la plateforme OpenAlea (https://openalea.readthedocs.io/) et proposerait des simulations « test ». Vous assurerez également la formation sur vos réalisations auprès des scientifiques et des ingénieurs relais dans les différents laboratoires. Ce travail se réalisera en présentiel dans les différentes unités du projet (12 mois Montpellier + 4 mois Bordeaux) Dans un troisième temps, vous assurerez la valorisation de GrapeInSilico, par la réalisation d’une publication logicielle, et la mise en place de journées de présentation / communication à destination des différents partenaires publics et privés.

Formation et compétences

Vous être ingénieur agronome (ou équivalent) avec des compétences en modélisation ou informaticien avec un vif intérêt pour la recherche en biologie végétale. Vous avez des compétences en langage de programmation (R et/ou Python et/ou C++ et/ou Java). Vous êtes également motivé(e) par la communication et la formation et êtes capable de transmettre des logiciels et des modèles à des utilisateurs peu formés. Vous êtes mobiles, et notamment prêt(e) à réaliser une part significative de votre mission sur un lieu différent de votre affectation (Bordeaux).

 

Formation souhaitée : diplôme d’ingénieur / master2 agronome avec compétences en modélisation ou diplôme d’ingénieur/master2 en informatique.

Affectation et durée

 UMR INRAE-LEPSE, (Montpellier) pour une durée de 16 mois, avec mission longue durée à Bordeaux.

Début 1er Décembre 2021.

Rémunération

Environ 2400 euros brut/mois.

Candidature

Merci d’adresser CV et lettre de motivation à :

Christian Fournier : christian.Fournier@inrae.fr, Christophe Pradal : christophe.pradal@inria.fr, Benoît Pallas : benoit.pallas@inrae.fr

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