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Dernière mise à jour : Mai 2021

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PhenoPsis

PhenoPsis
© INRAE-LEPSE
La plateforme PHENOPSIS est un automate d'irrigation et de prises d'images situé en chambre de culture de 1,5 x 5 m. Il s'agit d'un prototype construit par Optimalog (France) en 2003. Depuis 2007, le LEPSE dispose de 3 automates PHENOPSIS. Grâce à un bras amovible (x,y,z) il permet de peser, d'irriguer précisément jusqu'à un poids cible défini par l'expérimentateur et prendre des images (visible, infra-rouge, fluorescence) sur plus de 500 petites plantes/PHENOSPIS, comme la plante modèle Arabidopsis thaliana. Aujourd'hui, de nouvelles espèces peuvent être accueillies dans des conditions environnementales rigoureusement contrôlées.

Phenopsis est un robot automatique d'arrosage et d'imagerie installé dans trois chambres de croissance, chacune avec 500 plantes. Initialement développé pour la plante modèle Arabidopsis thaliana, il a récemment été amélioré pour accueillir d'autres espèces avec une architecture aérienne différente, comme le colza, la tomate ou le Brachypodium. Il peut prendre des images RVB (top et / ou side view), infrarouges et fluorescentes. Il a servi à des analyses QTL à plusieurs traits impliquant l'expansion des feuilles, la division cellulaire et la formation de feuilles avec un état contrasté de l'eau du sol. Il a également été utilisé pour tester de grandes séries d'accessions d'origine contrastée et de plantes transgéniques ciblées et d'associer des phénotypes à la transcriptomique, à la protéomique et à la métabolomique.

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RegionOcc-Feder

Exemple d'une expérimentation réalisée sur PhenoPsis :

Voir aussi

Retrouvez ici l'article paru dans Le Cahier des Techniques de l'INRA sur les évolutions technologiques du premier automate de phénotypage des plantes

Retrouvez ici un poster sur PhenoPsis

Contexte - Historique

PHENOPSIS est un prototype crée en 2002 par une étroite collaboration entre les techniciens du LEPSE et la société française OPTIMALOG. C'est...
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Caractéristiques actuelles pour de nouveaux challenges dans le phénotypage des plantes

Depuis 2007, PHENOPSIS a été régulièrement amélioré de façon à pouvoir faire face à de nouveaux challenges dans le domaine de phénotypage...
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Équipements

Trois chambres de culture sont chacune équipées d'un automate équipé de stations de pesées/irrigations et d'imagerie.
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Applications réalisées

PHENOPSIS a été utilisé dans différents contextes : pour les questions de recherche du LEPSE, pour des projets collaboratifs mais aussi pour des...
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Que se passe t-il dans PHENOPSIS ?

Arabidopsis thaliana est encore la plante modèle utilisée dans PHENOPSIS mais, depuis 2013, PHENOPSIS est aussi utilisée pour cultiver du Colza,...
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L'équipe PHENOPSIS

Une équipe multi-disciplinaire travaille pour le fonctionnement et le développement de la plateforme PHENOPSIS et vient en appui aux expérimentations
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Accès aux données de PHENOPSIS

Les données publiques produites sont disponibles depuis notre système d'information.
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Les publications parues avec des données issues de PHENOPSIS

L'article présentant PHENOPSIS paru en 2006 dans New Phytologist a été cité 320 fois (octobre 2020) et 45 articles sont parus depuis dans des...
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