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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Équipements

Trois chambres de culture sont chacune équipées d'un automate équipé de stations de pesées/irrigations et d'imagerie.

Les trois chambres de culture individuelles sont équipées d'un automate sur lequel sont embarquées des stations de pesées/irrigations et d'imagerie.

Chaque automate est placé dans une chambre de culture de (15 m3) comprenant (i) un plafond lumineux composé de lampes HQi et de néons, des sécheurs d'air, des humidificateurs des refroidisseurs et chauffeurs d'air; (ii) des capteurs micro-météorologiques sont connectés à une centrale d'acquisition de données; (iii) un support en acier supporte les plateaux troués qui vont contenir les pots pendant une expérimentation (les trous dans ces plateaux sont de tailles différentes suivant les pots utilisés) ; (iv) le bras de l'automate qui comprend dans sa partie inférieure une balance (PRECISA); dans sa partie supérieure un capillaire d'irrigation relié à une pompe péristaltique (ou deux capillaires reliés à deux pompes distinctes suivant les expérimentations); deux caméras (une en position verticale, l'autre horizontale, Prosilica); une caméra infra-rouge (FLIR); et une caméra de fluorescence (WALTZ).

PHENOPSIS-equipment_reference

Le tout est connecté à un ordinateur qui contrôle à la fois les conditions micro-météorologiques de la chambre de culture et l'automate. Un serveur permet la sauvegarde des toutes les données (environnementales, images, données phénotypiques). Un système d'information permet d'avoir accès aux images et aux données et permet des analyses de données avec des scripts en ligne.

PHENOPSIS-data_reference

En bref, ce qu'il est possible de faire dans PHENOPSIS:

PHENOPSIS permet de cultiver 1516 plantes de petites tailles dans des pots cylindriques de 225ml ou des plantes de plus grandes tailles dans 70 pots de 7l. Au niveau du sol le rayonnement incident peut atteindre 180-200 µmol m-2 s-1  pendant une durée de photopériode décidée par l'expérimentateur. Suivant les besoins de l'expérimentation, la température de l'air peut être maintenue entre 18 et 30°C, l'humidité de l'air entre 60 et 75%. La teneur en eau du sol peut être ajustée pot à pot avec une ou deux solutions nutritives par expérimentation. Les plantes peuvent être prises en images avec une vue de dessus et/ou de coté. Des images thermiques et de fluorescence peuvent aussi être obtenues automatiquement suivant le but de l'expérimentation. Des macros ImageJ sont disponibles pour analyser de façon automatique ou semi-automatique les lots d'images pris dans une expérimentation. La balance de l'automate peut être utilisé pour effectuer des mesures de transpiration des plantes si les plantes sont isolées du sol par des films plastiques. Les données phénotypiques issues des images ou des pesées peuvent être complétées par des données acquises manuellement qui peuvent être non-destructives (photosynthèse) ou destructives (récolte du système racinaire, observation des tissus, récoltes pour analyses biochimiques ou moléculaires etc...).