L’Unité de Biométrie de l'ENSAM (Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie de Montpellier) a été créée en 1982 sur le campus de la Gaillarde, avec des activités de recherche portant essentiellement sur la statistique appliquée à l’agronomie. Elle a été dirigée par Yves Escoufier puis Alain Berlinet, professeurs à l'Université Montpellier II. Jean-Pierre Vila, directeur de recherche à l'INRA, a pris sa direction en 1994 et crée en 1998 l'unité mixte de recherche INRA/SupAgro ASB (Analyse des Systèmes et Biométrie).

L'UMR ASB a pris la suite de l'unité de biométrie, en ouvrant une orientation complémentaire en modélisation et commande de systèmes dynamiques. Pierre Cartigny, professeur des universités, a dirigé l'UMR de 2008 à 2009. Alain Rapaport, directeur de recherche à l'INRA a pris la direction de l'UMR de 2009 à 2014, épaulé par Pascal Neveu comme directeur adjoint. En complémentarité aux activités de recherche en statistiques (plus orientées vers l’analyse de données fonctionnelles depuis 2008) et en modélisation/commande de systèmes dynamiques, les activités autour de la représentation de la connaissance et des systèmes d’information se sont considérablement renforcées, si bien qu’en 2009, l’UMR a été renommée ‘MISTEA’, pour afficher les trois thèmes méthodologiques (mathématiques, statistique et informatique).

En parallèle, en 2004, une équipe projet INRIA commune avec l’INRA intitulée ‘MERE’ (Modélisation Et Ressources en Eau) a été fondée par Claude Lobry. En 2012, une nouvelle équipe commune INRA/INRIA ‘MODEMIC’ (Modélisation et Optimisation des Dynamiques des Ecosystèmes MICrobiens) lui a succédé; elle était alors accueilli par MISTEA.

MISTEA, dirigée depuis 2014 par Pascal Neveu, puis rejoint à la direction par Nadine Hilgert fin 2017, est restée structurée en deux équipes de recherche jusqu'en 2020: MOCAS (Modélisation, Optimisation et Commande des Agro-Systèmes, issue de MODEMIC en 2016) et GAMMA (gestion et analyse statistique de données en agronomie). Elle est depuis structurée en 3 axes: Systèmes Dynamiques, Probabilités Statistiques, et Informatique.