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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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Logiciels & Plateformes

https://actif-numerique.inrae.fr/ansci/app/view/all?unites=0729

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Software: AgroPortal - A vocabulary and ontology repository for agronomy and related domains

http://agroportal.lirmm.fr

https://github.com/agroportal

BECKEY

Software: Understanding, Comparing and Discovering Keys of Different Semantics in Knowledge Bases

https://github.com/danaiS/BECKEY

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bliss

package R: Bayesian functional Linear regression with Sparse Step functions (BLiSS)

A method for the Bayesian Functional Linear Regression model (functions-on-scalar), including two estimators of the coefficient function and an estimator of its support. A representation of the posterior distribution is also available.

https://pmgrollemund.github.io/bliss/
https://github.com/pmgrollemund/bliss
https://cran.r-project.org/web/packages/bliss/index.html

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Software: Action Depollution - a serious game to learn how to decontaminate a lake in closed loop, developed with Inria, Funkadelichik and sponsorised by CapMaths.

https://depoll-game.inria.fr/

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DrBats

package R: Feed longitudinal data into a Bayesian Latent Factor Model to obtain a low-rank representation. Parameters are estimated using a Hamiltonian Monte Carlo algorithm with STAN.

https://cran.r-project.org/web/packages/DrBats/
https://forgemia.inra.fr/benedicte.fontez/drbats

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geozoning

package R: a zoning method for spatial data

https://github.com/hazaeljones/geozoning

cellulose

software: An individual-based model for the degradation of one cellulose bead (dozens of micrometers in diameter) by cellulolytic bacteria. Developed in 2013 in the context of the ANR Syscom project DISCO and the RNCS MnMs .

http://www-sop.inria.fr/members/Fabien.Campillo/software/ibm-cellulose/

logo_fis

Software: Conception et optimisation de systèmes d'inférence floue
https://www.fispro.org/fr/

logo_geofis

Software: Traitement de données spatialisées pour l'aide à la décision
https://www.geofis.org/fr/

logo_mode

Software: An Individual-based model simulator for clonal plant growth developed in 2011 and 2012 in the context of the ANR Syscom project Modecol, in Matlab.
http://www-sop.inria.fr/members/Fabien.Campillo/software/ibm-clonal/

sticker_kfino

kfino

Package R: Kalman filter with impulse noised outliers (kfino) is a robust sequential algorithm allowing to filter data with a large number of outliers. This algorithm is based on simple latent linear Gaussian processes as in the Kalman Filter method and is devoted to detect impulse-noised outliers. These are data points that differ significantly from other observations.
https://forgemia.inra.fr/isabelle.sanchez/kfino
https://CRAN.R-project.org/package=kfino

logo_opensilex

The OpenSILEX open source software allows building information systems to manage experimental data.
http://www.opensilex.org/
In an open science approach, OpenSILEX is ontology-driven and implements the FAIR principles for Easy to Find, Accessible, Interoperable and Reusable data.
Its architecture allows to manage large volumes of complex heterogeneous data.
    * Ontology-driven architecture
    * Fair data
    * Modular architecture
    * BrAPI compatibility
    * Adaptability
OpenSILEX is derived in several implementations corresponding to specific scientific communities:
    * PHIS (high throughput plant phenotyping),
    * Sixtine (experimental plant units at INRAE),
    * SunAgri (agrophotovoltaic),
    * Silex-VitiOeno (wine and viticulture),
    * Alfis (alcoholic fermentation data)
    * ENVIBIS (depollution).

Software: SOFA Logiciel de simulation des fermentations alcooliques développé conjointement avec l'UMR Sciences pour l'Oenologie (SPO), commercialisé par Intelli'Oeno

https://www.intellioeno.com/web/SOFA

logo_spicefp

SpiceFP

Package R: Sparse and Structured Procedure to Identify Combined Effects of Functional Predictors

https://github.com/giraultg/SpiceFP
https://cran.r-project.org/web/packages/SpiceFP/index.html

VICKEY

Software: Mining Conditional Keys on Knowledge Bases

https://github.com/lgalarra/vickey

vitelbio

VITELBIO: a web-service for the simulation and analysis of networks of interconnected chemostats, developed within the VITELBIO project.

http://vitelbio.itkweb.fr/vitelbio/