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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement

CDD 16 mois d'Ingénieur d'études en bioprocédés des microalgues (H/F)

Productivité en lipides des microalgues cultivées sur des effluents de fermentation sombre

Contexte

La fermentation sombre est un processus anaérobie qui convertit les déchets organiques en bioH2 et en acides gras volatils (AGV) tels que l'acétate et le butyrate. Les AGV et les nutriments dans les effluents de fermentation peuvent en présence de lumière être utilisés pour produire des microalgues (mixotrophie). La biomasse contient des lipides qui peuvent être transformés en esters éthyliques d'acides gras (FAEE) pour une utilisation comme biocarburant ou pour la chimie verte. Les recherches effectuées au LBE ont démontré que les microalgues peuvent se développer sur les effluents de fermentation, mais il a été constaté que la présence de butyrate et de bactéries fermentatives pouvait être problématique pour une productivité optimale des microalgues. Par conséquent, il est nécessaire d’étudier plus en détail l’assimilation du butyrate par les microalgues et l’impact de la présence de bactéries sur la croissance et la physiologie des microalgues. En parallèle, il faut évaluer comment la production de lipides par les microalgues peut être optimisée, par exemple en testant différentes souches ou conditions de culture.

Objectifs

Les travaux de l’ingénieur(e) seront effectués dans le cadre du projet Fermalip, financé par 3BCAR, qui vise à  développer un procédé intégré de la production de dérivés lipidiques à partir de biomasse microalgale produites sur des effluents de fermentation de déchets. Les objectifs du projet sont :

  1. établir les conditions opératoires pour une productivité optimale de la biomasse de microalgues et des lipides issus des effluents de fermentation des déchets,
  2. optimiser la fonctionnalisation et l'extraction des lipides sous forme d'esters éthyliques d'acides gras (FAEE) via le utilisation d'enzymes lipase et acyltransférase.

L’objectif 1 est principalement abordé au LBE à Narbonne, tandis que l’objectif 2 est étudié par le partenaire l’Unité Mixte de Recherche « Ingénierie des Agropolymères et Technologies Emergentes »  (UMR IATE) à Montpellier.

Mission

La mission du CDD est d’optimiser les conditions de croissance des microalgues sur effluents de fermentation et la productivité en lipides (Objectif 1). Un compromis doit être trouvé entre la production de biomasse et la quantité de lipides accumulés :

  • Déterminer quelles espèces d'algues et quelles conditions de culture permettent une productivité en biomasse et lipidiques optimales.
  • Etudier des conditions relatives aux nutriments, concentration / rapport en AGV et stockage anoxique pour augmenter la productivité lipidique.

Pour étudier la productivité des microalgues, le candidat utilisera dans un premier temps des effluents synthétiques, puis des effluents de fermentation réels provenant de différents types de déchets. Différentes souches de microalgues seront testées en différentes conditions de culture. Des activités principales sont :

  • préparation de milieux de culture
  • culture de microalgues en batch ou continu à l’échelle de 1mL jusqu’à 5L
  • suivi de biomasse
  • mesure des AGV par GC, des nutriments par chromatographie ionique
  • dosage de lipides et sucres
  • microscopie optique 
  • méthodes moléculaires rDNA pour déterminer la diversité microbienne
  • analyse et communication des résultats
  • bibliographie

Le travail se déroulera en collaboration avec l’équipe du Dr Maeva Subileau  (UMR IATE). La biomasse produite au LBE sera régulièrement analysée  à l’UMR IATE pour caractériser des lipides synthétisés et pour évaluer son potentiel de production de FAEE via l'action des lipases / acyltransférases à l’UMR IATE.

Profil

  • Diplôme : Ingénieur en Génie (micro)biologique, Génie des (bio)procédés, ou un Master 2 en (bio)chimie, Physiologie végétale ou Microbiologie.  
  • Compétences : Une expérience en culture de microorganismes idéalement des microalgues, et en analyses (bio)chimiques est souhaité. Connaissance du programme R est un atout, et un niveau suffisant en anglais pour lire des articles scientifiques.
  • Qualités : Dynamisme et curiosité, rigueur scientifique, esprit analytique, travail en équipe.

Conditions

  • Prise de fonction : 01 février 2021
  • Durée : 16 mois
  • Localisation : Unité Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement (LBE), INRAE de Narbonne
  • Rémunération : environ € 2000 brut (0-2 ans d’expérience souhaitée) 
  • Postuler : envoyer CV et lettre de motivation
  • Date limite: 14-12-2020

Contact

  • Dr. Robert van Lis (LBE-INRAE) robert.van-lis (at) inrae.fr
  • Dr. Maeva Subileau (UMR IATE) maeva.subileau (at) supagro.fr